複数のシステムと連携したいです。同じアカウントでもAPI利用料は連携の数だけ必要になりますか。

API利用料は、WAN-Signのアカウント毎に発生します。
同じWAN-Signのアカウントであれば、連携先システムが複数存在しても料金の追加はありません。